Acetato lo usan pero solo los metanogenos acetoclasticos. El caso es que la metanogenesis va a ocurrir en anaerobiosis si o si. Y en esas condiciones, los hongos tienen que sobrevivir a base de fermentacion... la verdad es que hongos en reactores anaerobios, e.g. UASB, no me suenan y al microscopio (he tenido muestras de mi mano) ni aparecen y serian bastante evidentes por el tamaño y por la tincion al microscopio de fluorescencia. No digo que no haya ni una celula pero dudo que lleguen siquiera a un 0,00001% de la poblacion. Bacterias y arqueas dominan el sistema.
Lo que dices en solido es una forma tambien de cultivo bastante comun para testar la degradacion de cascaras de semillas y similares como subproductos industriales, agricolas o forestales y su potencial uso, pero son generalmente muy lentos.
El pretratamiento con hongos seria mas bien por medio de enzimas producidas por ellos: lacasas, lignin peroxidasas, Mn-peroxidasas y enzimas varias capaces de degradar polimeros que muchos otros organismos no pueden tal como la quitina y queratina. Pero vamos, si no hay un producto de valor final considerable, las enzimas son demasiado caras como para aplicarlo. No olvidemos que los digestores son un tratamiento de desechos antes que productores de metano.
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