La causa de las ojeras se debe a la anatomía de los párpados.
Éstos tienen un tejido celular subcutáneo (tejido por debajo de la piel) con muy poca grasa comparado con el resto de tejidos de otras zonas. Al no tener grasa presenta mucha avidez por absorber agua.
Cuando estamos nerviosos o cansados por no dormir durante mucho tiempo, se produce un aumento en la retención de líquidos en los tejidos. Como los párpados absorben mucha agua enseguida se notan hinchados (además en esa zona la piel es muy fina) y es lo que da la característica ojera (que al fin y al cabo es una de forma de llamar así a los edemas en los párpados).

Dato CPI: Justo por esa misma capacidad para retener agua es por lo que en la vejez (donde hay una disminución de los volumenes de agua en los tejidos) en los párpados se noten más y sea el lugar en los que aparezcan las primeras arrugas por esa pérdida de agua.

En cuanto a lo del café no sé mucho. Hicieron un estudio hace poco que decía que sí, que estimula la memoria a corto plazo. Pero no tengo ni idea de cuánto. De todas formas los efectos no creo que fueran muy evidentes.

Shora, continuando con la pregunta...

¿Por qué las ojeras de no dormir son oscuras? Es decir, cuanto peor ritmo de vida llevo, no se me hinchan tanto las ojera como que me toman un color oscuro.

Respecto al café mi vida y mi memoria en general es mucho mejor desde que no ingiero ni pizca de cafeina. Nada, cero, nyet!

Y ningun problema para levantarme por las mañanas.. ¡viva la vida sin cafeína! ¡Soy un hombre libre!

El color de las ojeras está también relacionado con esa retención de líquidos que hacen que se formen una especie de bolsas en los ojos. Como ya he dicho antes la piel de los párpados es muy fina y el tejido celular subcutáneo apenas tiene grasa. Por ello cuando las venas que pasan por esa zona se dilata por un aumento del flujo sanguíneo aparece la coloración característica que hace contraste con el color de la piel.
Si el sujeto tiene la piel bastante oscura y gruesa, las ojeras serán marrones. Si la tiene clara y fina de color violeta azulado. Si se encuentra una piel entrel clara y oscura serán más o menos verdes.

Vamos, que el color de las ojeras se debe al contraste de la sangre de las venas dilatadas con la piel. Además eso va unido a la retención de líquidos en los tejidos (edema) que hace que sean aún más visibles.